上帝说，我会回来的，当我回来时，我要毁灭这个世界！



　　挪亚遵从上帝的旨意建造了方舟，使地球上的生命从大洪水中存活了下来。这次大洪水是上帝的惩罚，被称为第一次冲击。从考古学的角度来说，远古确实有过一次毁灭了世界上大部分人口和许多史前文明的大洪水，并留存于世界上各个民族的传说中。



　　公元2000年8月，葛城考察队到达南极，他们发现的巨大人形生命体，实际上是Adam与Lilith的融合体。葛城的计划是攫取或控制Adam与Lilith的S^2机关，将Adam与Lilith分离并缩小后用于人类未来的补完计划。但是有件事他不知道，Adam与Lilith无论是融合还是分离都会释放巨大的爆炸能量和反ATField力，这就与核聚变与核裂变都会产生大爆炸与冲击波的原理一样，只是爆炸当量不同。所以尽管Adam与Lilith分离所造成的灾难不会灭亡全部人类，但却将杀死地球上的一半人口。而十六年后的第三次冲击是Adam与Lilith的重新融合，整个世界都将再劫难逃







时间是公元2015年。　南极的冰雪溶解造成世界的危机（第二次冲击）后的复兴时代。　箱根建设中的计画都市，「第3新东京市」遭到突如袭来的来历不明的巨大生物体“使徒”的攻击，此时，在已封锁的街道上，有一位彷徨的少年…… 　使徒的物质构成、来源、目的等一切不明。形态机能与特殊能力使人类一切的战斗防御设施望尘莫及，是对全人类发起挑战。　对战谜之敌人“使徒”，人类能与之対抗的唯一手段即「泛用人型决戦兵器エヴァンゲリオン」（EVANGELION）。　国际连合直属的特务机关「ネルフ（NERV）」有着主人公「碇シンジ」等3人的少年少女EVA操縦者。现在，人类的命运与战争的胜利都寄托在他们身上。　“使徒”的真面目究竟是什么？少年与全人类的命运最终如何？　刺激紧张的战斗！　谜中还有谜的惊险故事！　少年少女们的纠纷，内心的成长