在现代，忍者依然存在，他们在暗地里活动着，他们把他们的世界称为“隐世”……

传说最强的秘术“森罗万象”可以化一切不可能为可能，它消失多年后突然出现，为了夺取这种无与伦比的力量，消沉已久的隐世再度活跃起来，开始了对秘术的争夺，然而就是在十年前秘术出现万人抢的时候，所有隐世的人全部失去了记忆……

六条壬晴是个对周遭的人事物漠不关心的中学生。

可是他的体内却隐藏着足以撼动整个隐世的最强的秘术——[森罗万象]。

壬晴的英语教师云平·帷·杜兰达与壬晴的同学虹一都是“万天之里”的忍者，他们自称是“秘术捍卫派”，绝不允许任何人滥用秘术，他们让壬晴加入忍术社保护壬晴的安全，并教授壬晴忍术。

然而一场争夺秘术的风暴再次来临，最早行动的就是伊贺的“灰狼众”，打破了壬晴日常的生活，云平老师告诉壬晴，若想恢复独善其身的生活，唯一的办法就是成为隐王！于是他被迫走进隐世，迎来向未知的挑战！