六条壬晴是一个对周遭的人事物都漠不关心的中学生，可是他的体内却隐藏着忍者的世界（也就是隐世）最强的秘术「森罗万象」。为了夺取这种无与伦比的力量，源自伊贺忍者的“灰狼众”全体出动，誓言要将壬晴带回伊贺之里。

另一方面，壬晴的英语教师云平与壬晴的同学虹一都是万天之里的忍者，他们的任务就是保护壬晴的安全。一场“森罗万象”的争夺战将各方忍者卷入其中，壬晴若想恢复独善其身的生活，唯一的办法就是成为隐王！于是他被迫走进隐世，迎向未知的挑战！