私立银成学园高校。　　过着普通高校生活的武藤，一日晚上为救一名遭到怪物袭击的少女而不幸丧命。然而，那个少女却用她的炼金术研究成果研制出了一种能够起死回生的;核铁;。与此同时，掌握了武装炼金的武藤，知道了食人怪物的存在，于是世界陷入了战争的威胁之中。在一场场战斗中，武藤作为一名炼金战士而成长着。　　那么，;核铁;蕴涵的真正力量是什么呢？……